不同类型内蒙古白绒山羊瘤胃甲烷菌数量及多样性比较研究

【摘要】：分别采集阿尔巴斯型、二郎山型、阿拉善型白绒山羊瘤胃液，通过发酵参数测定、限制性片段长度多态性分析（RFLP）、实时荧光定量分析（qPCR），对三种类型内蒙古白绒山羊瘤胃发酵特性、产甲烷菌菌群多样性和数量进行比较研究。 试验一，不同类型内蒙古白绒山羊瘤胃发酵参数的比较研究。 试验结果表明，阿拉善型瘤胃液pH值显著低于阿尔巴斯型（P=0.017），其它各组之间无显著差异。阿拉善型氨态氮浓度极显著高于阿尔巴斯型和二郎山型（P0.001）。乙酸浓度阿拉善型极显著高于阿尔巴斯型（P=0.007）。丙酸浓度阿拉善型显著高于阿尔巴斯型（P=0.025）。丁酸浓度阿拉善型显著高于阿尔巴斯型和二郎山型（P=0.023）。乙酸/丙酸阿尔巴斯型极显著低于二郎山型和阿拉善型（P=0.004）。总挥发性脂肪酸浓度阿拉善型显著高于阿尔巴斯型（P=0.011）。 试验二，不同类型内蒙古白绒山羊瘤胃甲烷菌多样性的比较研究。 提取三种白绒山羊瘤胃液微生物基因组，选取特异性引物Met86f/Met1304r扩增瘤胃甲烷菌16srDNA基因片段，并建立基因文库，用限制性内切酶Hind III进行RFLP分析，建立系统进化树。结果表明，不同类型内蒙古白绒山羊瘤胃中甲烷菌菌群不同，即阿尔巴斯型：3种产甲烷菌，优势甲烷菌为DQ402028，属于未培养的产甲烷菌。阿拉善型：4种甲烷菌，优势菌为DQ135988，属于甲烷短杆菌。二郎山型：3种甲烷菌，优势菌为JF807221，属于未培养的产甲烷菌。 试验三，不同类型内蒙古白绒山羊瘤胃甲烷菌数量的比较研究。 选取甲烷菌特异性引物Met630F/Met803R进行PCR扩增，回收PCR产物中的DNA用以克隆，并提取标准质粒，构建标准曲线，根据标准曲线对瘤胃中甲烷菌进行绝对定量。结果表明，阿尔巴斯型、二郎山型和阿拉善型内蒙古白绒山羊瘤胃液中产甲烷菌的拷贝数依次为4.5×10~8、6.68b×10~8、3.89×10~9copy/ml，且阿尔巴斯型极显著高于阿拉善型（P0.001）。 【关键词】：内蒙古白绒山羊 瘤胃发酵特性 甲烷菌 多样性 绝对定量
【学位授予单位】：内蒙古农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：S827
【目录】：

• 摘要3-4
• Abstract4-10
• 1 引言10-18
• 1.1 内蒙古白绒山羊10
• 1.2 瘤胃内环境10-11
• 1.3 甲烷菌11-16
• 1.3.1 甲烷菌的种类11-12
• 1.3.2 甲烷菌的特征12-13
• 1.3.3 瘤胃甲烷生成的途径13-14
• 1.3.4 甲烷菌多样性的研究14-15
• 1.3.5 甲烷菌定量研究15-16
• 1.4 研究目的及意义16-17
• 1.5 研究内容及技术路线17-18
• 1.5.1 研究内容17-18
• 1.5.2 技术路线18
• 2 试验研究18-41
• 2.1 不同类型内蒙古白绒山羊瘤胃发酵参数的比较18-23
• 2.1.1 试验材料19
• 2.1.2 试验测定指标与方法19-20
• 2.1.3 试验数据处理与分析20
• 2.1.4 结果与分析20-21
• 2.1.5 讨论21-23
• 2.1.6 小结23
• 2.2 不同类型内蒙古白绒山羊瘤胃产甲烷菌多样性比较研究23-33
• 2.2.1 试验材料24
• 2.2.2 试验方法24-26
• 2.2.3 试验结果26-31
• 2.2.4 讨论31-32
• 2.2.5 小结32-33
• 2.3 不同类型内蒙古白绒山羊甲烷菌绝对定量的研究33-41
• 2.3.1 试验材料33-34
• 2.3.2 试验方法34-35
• 2.3.3 结果与分析35-40
• 2.3.4 讨论40-41
• 2.3.5 小结41
• 3 论文总体结论、不足与展望41-43
• 3.1 论文总体结论41
• 3.2 论文不足与展望41-43
• 致谢43-44
• 参考文献44-52
• 附录52-57
• 作者简介57

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