PCR-DGGE技术在水牛瘤胃产甲烷古菌多样性探索中的应用

【摘要】：采集16头广西本地沼泽型水牛瘤胃内容物,提取总DNA,利用产甲烷古菌通用引物扩增I6SrRNA基因序列,进行DGGE分析。将DGGE凝胶上7条优势条带进行回收克隆测序,得到9条序列,其中3条与甲烷短杆菌(Methanobrevibacter)的同源性也高达99%。1条与甲烷短杆菌的同源性达98%,1条序列与广古菌门(Euryarchaeota)热原体目(Thermoplasmatales)的同源性达98%。另外,有4条是和古菌存在序列相似性的未培养细菌,分别属于拟杆菌(Bacteroidetes),厚壁菌(Firmicutes),变形菌门(Proteobacteria.),几个细菌门类之间无太大同源性。 【作者单位】：广西大学动物科学技术学院
【关键词】：水牛 瘤胃 产甲烷古菌 PCR-DGGE
【基金】：广西大学研究生创新课题2007105930905M079
【分类号】：S823
【正文快照】： 产甲烷菌阿ethanogen)是一类严格厌氧的古菌(Archaea)，隶属广古菌门(E uryarehaeota)。古菌是1990年woese著名的三域学说明确区分出来的有别于细菌和真菌的另一域微生物。目前，为人类所分离鉴定的产甲烷菌已有200多种，归为3纲5目10科29个属[1]。截止到2009年，美国国立生

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