PCR-DGGE技术在水牛瘤胃产甲烷菌多样性分析中的应用

【摘要】：【目的】分析水牛瘤胃产甲烷菌的多样性,为更好地了解水牛瘤胃产甲烷菌提供科学依据。【方法】采集16头广西本地沼泽型水牛瘤胃内容物,提取总DNA,利用产甲烷菌的通用引物扩增16SrRNA基因序列进行DGGE分析,并对DGGE凝胶上7条优势条带进行回收克隆测序。【结果】共获得9条序列(5条为古菌序列、4条为非古菌序列),5条古菌序列中有3条与甲烷短杆菌(Methanobrevibacter)的同源性高达99%、1条与甲烷短杆菌的同源性达98%、1条与广古菌门(Euryarchaeota)热原体目(Thermoplasmatales)的同源性达98%;而4条非古菌序列分别属于拟杆菌(Bac-teroidetes)、厚壁菌(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria),且彼此间同源性较小。【结论】通过PCR-DGGE技术可以较好地分析水牛瘤胃产甲烷菌的多样性。 【作者单位】： 广西大学动物科学技术学院;河北省科学院生物研究所;河南黄淮学院;
【关键词】： 水牛 瘤胃 产甲烷菌 PCR-DGGE 多样性分析
【基金】：广西大学研究生创新计划项目(2007105930905M079)
【分类号】：S823.83;S852.6
【正文快照】： 0引言【研究意义】产甲烷菌(Methanogen)是一类严格厌氧的古菌(Archaea),隶属广古菌门(Euryarchaeota)。目前,分离鉴定的产甲烷菌已有200多种,归属于3纲5目10科29个属。截至2009年,美国国立生物技术信息中心(NCBI)公布全基因组测序序列的产甲烷古菌已经有22株(朱晨光等,2009)

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