应用DGGE分析秸秆日粮对奶牛瘤胃细菌群落的影响

【摘要】：【目的】通过与苜蓿日粮比较,揭示秸秆日粮模式下瘤胃固液相细菌群落的独特结构。【方法】选择12头健康且体重相似的装有永久瘤胃瘘管的中国荷斯坦奶牛,分别饲喂以玉米秸秆(CS)和苜蓿、羊草、青贮玉米三者混合物(MF)为粗饲料组成的日粮,正饲期第13周连续3 d分12个时间点采集瘤胃固、液相内容物样品。提取微生物DNA后,利用PCR结合变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)分析细菌群落结构,并进行聚类分析及差异条带的测序分析。【结果】与MF组相比,CS组奶牛瘤胃固、液相细菌DGGE图谱条带的数目和光密度均有一定差异,两处理组都各有一些稍显优势的条带,CS组优势条带要少于MF组。与MF组相比,CS组液相细菌的香浓多样性指数无差异(P0.05),固相细菌香浓多样性指数显著降低(P0.01);通过对差异条带进行测序,发现与MF组相比,CS组中瘤胃细菌Prevotella sp.、Acetivibrio ethanolgignens和Clostridium sp.减少,并且大量来源于Bacteroidetes、Firmicutes、Tenericutes和Proteobacteria等菌门的未培养细菌有所变化。【结论】秸秆日粮条件下奶牛瘤胃存在独特的细菌群落结构,细菌多样性较低。 【作者单位】： 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/动物营养学国家重点实验室;
【关键词】： 秸秆 粗饲料类型 瘤胃 细菌群落 DGGE
【基金】：国家“973”计划项目(2011CB100804)
【分类号】：S823.5
【正文快照】： 0引言【研究意义】目前,在中国畜牧业中苜蓿等优质粗饲料资源短缺,进口量在逐年增加,而玉米秸秆资源丰富,2010年中国秸秆总量达到7亿吨,饲用秸秆占到30%。奶牛养殖中秸秆粗饲料所占的比重较大,但是玉米秸秆作为奶牛的粗饲料利用率低,影响奶牛的生产水平。粗饲料在反刍动物体内

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