不同粗饲料条件下梅花鹿瘤胃甲烷菌结构的比较分析

【摘要】：本研究旨在基于高通量测序技术分析比较采食3种常见粗饲料梅花鹿瘤胃甲烷菌结构。选取3只2岁龄的装有永久性瘤胃瘘管的成年雄性梅花鹿为研究对象,采用3×3拉丁方设计,分别饲喂以柞树叶(OL组)、玉米秸秆(CS组)和玉米青贮(CI组)为主要粗饲料的饲粮。预试期为1周,正试期为4周。采用引物A519F、A976R扩增瘤胃甲烷菌16S rRNA基因V3~V4区,基于Illumina M iseq PE250平台进行测序。结果表明:9个样本共获得600 352条高质量的甲烷菌16S rRNA基因序列,基于97%相似性共归为111个分类操作单元(OTU)。覆盖度指数表明本试验样品覆盖了瘤胃99%的甲烷菌。分类分析结果表明甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter spp.)[OL组:(97.80±6.00)%;CS组:(97.10±1.50)%;CI组:(87.50±5.50)%]是梅花鹿瘤胃优势甲烷菌,但采食3种粗饲料梅花鹿瘤胃甲烷菌在种水平的分布有差异。CI组Methanosphaera stadtmanae相对丰度显著高于OL组与CS组(P0.05)。OL组与CI组Methanobrevibacter millerae相对丰度高于CS组(P0.05),OL组与CS组Methanobrevibacter boviskoreani相对丰度高于CI组(P0.05),而CS组与CI组Methanobrevibacter olleyae相对丰度高于OL组(P0.05)。本研究发现Methanobrevibacter spp.是梅花鹿瘤胃优势甲烷菌。 【作者单位】： 中国农业科学院特产研究所经济动物研究室;
【关键词】： 梅花鹿 甲烷菌 Methanobrevibacter spp. 粗饲料
【基金】：国家自然科学基金(31501984) 吉林省重大科技攻关专项(20140203018NY)
【分类号】：S825.5
【正文快照】： 甲烷是一种与全球气候变化密切相关的温室气体。据统计,畜牧业贡献了全球9%~18%的温室气体排放,其中反刍动物排放占有率为80%,同时反刍动物的甲烷形成过程也导致机体损失2%~12%的净能量[1-2]。因此,反刍动物的甲烷排放越来越受到人们的关注。对反刍动物而言,甲烷主要是由瘤胃

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