山羊瘤胃产甲烷古菌多样性及与其他动物瘤胃的比较

【摘要】：旨在研究山羊瘤胃产甲烷古菌的多样性并与其他动物瘤胃进行比较。采用产甲烷菌特异性引物Met86F/Met1340R研究山羊瘤胃产甲烷古菌16SrRNA基因的多样性,随机挑选100个克隆进行序列分析。结果表明,所有克隆经限制性内切酶酶切后共获得16个OTU,绝大多数为甲烷短杆菌,其中与甲烷短杆菌菌株AK-87、ZA-10、OCP、SM9和30Y序列最相近的克隆数分别为58%、19%、7%、2%和2%,还有与Methanosphaera stadtmanae(1%)、Methanobacterium aarhusense(2%)、Aciduliprofundum boonei(3%)、Methanobrevibacter sp.AK-87(4%)和Methanobrevibactersp.1Y(2%)等相似的古菌序列。将研究结果与已经报道的关于牛和绵羊瘤胃产甲烷菌多样性比较,发现不同PCR引物可检测出不同菌群结构,而饲料类型、动物种类可影响瘤胃产甲烷菌的菌群结构。 【作者单位】： 南京农业大学动物科技学院消化道微生物研究室;山西农业大学动物科技学院;
【关键词】： 山羊 瘤胃 产甲烷菌 分子多样性
【基金】：国家自然科学基金项目(30530560)
【分类号】：S827;S852.6
【正文快照】： 反刍动物瘤胃代谢产生的甲烷不仅会造成饲料的能量损失,同时甲烷也是主要的温室气体,因此瘤胃产甲烷菌的研究日益受到关注。迄今为止,瘤胃产甲烷菌的研究主要来自牛和绵羊,并且发现不同动物瘤胃中的产甲烷菌群存在差异[1-3]。Ley等[4]认为肠道微生物的多样性可能是宿主和肠道

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