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湿地亚硝酸盐型厌氧氨氧化和厌氧甲烷氧化微生物生态学研究

来源:论文学术网
时间:2024-08-18 16:58:36
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湿地亚硝酸盐型厌氧氨氧化和厌氧甲烷氧化微生物生态学研究【摘要】:基于亚硝酸盐为电子受体的厌氧氨氧化(anaerobic ammonium oxidation, ANAMMOX)反应

【摘要】:基于亚硝酸盐为电子受体的厌氧氨氧化(anaerobic ammonium oxidation, ANAMMOX)反应和厌氧甲烷氧化(nitrite-dependent anaerobic methane oxidation, N-DAMO)反应是微生物氮循环和碳循环的最新内容,它们的发现对完善全球碳氮循环具有重要意义。 目前关于ANAMMOX的研究主要集中在人工环境和海洋环境;N-DAMO的各方面研究尚处于起步阶段,自然环境中N-DAMO的研究屈指可数。湿地是地球上最重要的自然生态系统之一。本论文以不同湿地类型(包括淡水湿地和滨海湿地)作为研究对象,对ANAMMOX和N-DAMO微生物进行生态学研究,以期探明这两类微生物在湿地系统中的生态分布特征、作用强度以及在湿地碳氮循环、温室气体减排和氮素污染修复中的作用。主要研究结果如下: 1)探明了湿地系统ANAMMOX菌和N-DAMO菌的群落结构特征 ①探明了湿地系统ANAMMOX菌的群落结构特征 淡水和滨海湿地系统中存在多个属的ANAMMOX菌及多个新的分支,种群多样性水平较高。在淡水湿地系统中,Candidatus Kuenenia和Candidatus Brocadia属是优势ANAMMOX菌。在滨海湿地系统中, Candidatus Kuenenia和Candidatus Brocadia属是氮素污染严重的近岸沉积物的优势ANAMMOX菌,Candidatus Scalindua属是污染相对较弱的外海沉积物的优势ANAMMOX菌。研究发现,沉积物/土壤有机碳含量和无机氮(氨氮和硝氮)含量是影响淡水湿地系统ANAMMOX菌群落结构的主要环境因子;沉积物孔隙水或上覆水无机氮(硝氮)浓度是影响滨海湿地系统ANAMMOX菌群落结构的主要环境因子。 ②探明了湿地系统N-DAMO菌的群落结构特征 淡水湿地和滨海湿地系统中存在多个与Candidatus Methylomirabilis oxyfera亲缘关系较近的分支,种群多样性水平较高。在淡水湿地系统中,group A的N-DAMO菌(N-DAMO反应的主要功能微生物)主要分布于深层土壤,group B的N-DAMO菌主要分布于表层土壤。在滨海湿地系统中,group A的N-DAMO菌是近岸沉积物的优势N-DAMO菌,group B的N-DAMO菌是外海沉积物的优势N-DAMO菌。研究发现,沉积物/土壤无机氮(氨氮和硝氮)含量和甲烷含量是影响淡水湿地系统N-DAMO菌群落结构的主要环境因子;沉积物有机碳含量及孔隙水或上覆水无机氮(硝氮)浓度是影响滨海湿地系统N-DAMO菌群落结构的主要环境因子。 2)探明了湿地系统ANAMMOX菌和N-DAMO菌的数量分布特征 ①探明了湿地系统ANAMMOX菌的数量分布特征 淡水和滨海湿地系统中都存在相当数量的ANAMMOX菌,数量范围为105~107拷贝g-1(干重)。在淡水湿地系统中,表层土壤中ANAMMOX菌数量明显高于深层土壤中ANAMMOX菌数量;在滨海湿地系统中,近岸沉积物中ANAMMOX菌数量明显高于外海沉积物中ANAMMOX菌数量。研究发现,沉积物/土壤无机氮(氨氮和硝氮)含量和有机碳含量是影响淡水湿地系统ANAMMOX菌数量分布的主要环境因子;沉积物孔隙水或上覆水无机氮(硝氮)浓度是影响滨海湿地系统ANAMMOX菌数量分布的主要环境因子。 ②探明了湿地系统N-DAMO菌的数量分布特征 淡水和滨海湿地系统中都分布有大量的N-DAMO菌,数量范围为105~107拷贝g-1(干重)。在淡水湿地系统中,深层土壤中N-DAMO菌数量明显高于表层土壤中N-DAMO菌数量;在滨海湿地系统中,近岸沉积物中N-DAMO菌数量明显高于外海沉积物中N-DAMO菌数量。研究发现,沉积物/土壤有机碳含量和甲烷含量是影响淡水湿地系统N-DAMO菌数量分布的主要环境因子;沉积物有机碳含量及孔隙水或上覆水无机氮(硝氮)浓度是影响滨海湿地系统N-DAMO菌数量分布的主要环境因子。 3)探明了湿地系统ANAMMOX菌和N-DAMO菌的活性和相对作用强度 ①探明了湿地系统ANAMMOX菌的活性和相对作用强度 淡水和滨海湿地系统中都存在大规模的ANAMMOX反应,反应速率为2.8~89.7nmol N2g-1(干重)d-1。 ANAMMOX反应在湿地系统微生物氮循环中的贡献率为1.3%-46.7%。在淡水湿地系统中,表层土壤中ANAMMOX活性明显高于深层土壤中ANAMMOX活性;在滨海湿地系统中,近岸沉积物中ANAMMOX活性明显高于外海沉积物中ANAMMOX活性。研究发现,土壤无机氮(氨氮)含量是影响淡水湿地ANAMMOX活性分布的主要环境因子;沉积物孔隙水或上覆水无机氮(硝氮)浓度是影响滨海湿地ANAMMOX活性分布的主要环境因子。 ②探明了湿地系统N-DAMO菌的活性和相对作用强度 淡水和滨海湿地系统中同样存在大规模的N-DAMO反应,反应速率为0.1~14.5nmol CO2g-1(干重)d-1。N-DAMO反应在湿地系统微生物甲烷氧化中的贡献率为1.0%~9.5%。在淡水湿地系统中,深层土壤中N-DAMO活性明显高于表层土壤中N-DAMO活性。在滨海湿地系统中,近岸沉积物中N-DAMO活性明显高于外海沉积物中N-DAMO活性。研究发现,土壤甲烷含量是影响淡水湿地N-DAMO活性分布的主要环境因子;沉积物孔隙水或上覆水无机氮(硝氮)浓度是影响滨海湿地N-DAMO活性分布的主要环境因子。 4)评价了湿地系统ANAMMOX反应和N-DAMO反应的生态环境效应 ①评价了湿地系统ANAMMOX反应的生态环境效应 通量计算发现,淡水湿地和滨海湿地系统中由ANAMMOX反应所致的氮通量达到了24.8~116.1g Nm-2year-1,与已报道的湿地反硝化氮通量(24.0-175.0g N m-2year-1)相当,表明ANAMMOX反应是湿地微生物氮循环的重要组成部分,对湿地氮循环和平衡湿地氮的收支具有重要意义。据估计,ANAMMOX反应可去除湿地系统平均外源氮负荷的10.3%~48.1%,是湿地重要的无机氮汇,可大大减缓河流、湖泊和近海等水体环境的富营养化进程。 ②评价了湿地系统N-DAMO反应的生态环境效应 通量计算发现,淡水湿地和滨海湿地系统中由N-DAMO反应所致的氮通量为1.0~-5.4g Nm-2year-1,表明N-DAMO反应对湿地氮循环和平衡湿地氮的收支也具有一定意义。据估计,N-DAMO反应可去除湿地系统平均外源氮负荷的0.4%~2.2%,其在减缓水体环境的富营养化进程中也起着一定作用。此外,湿地系统中由N-DAMO反应所致的甲烷氧化量为0.5-2.0g CH4m2year-1.据此推算,全球湿地系统中由N-DAMO反应所致的甲烷氧化总量可达4.0~20.0TgCH4year-1,占全球湿地系统甲烷排放总量(100.0~200.0Tg CH4year-1)的2.0%~20.0%,是湿地系统中被忽视的重要的温室气体甲烷的汇。 【关键词】:湿地 厌氧氨氧化 厌氧甲烷氧化 群落结构 数量 活性 相对作用强度 生态环境效应
【学位授予单位】:浙江大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2014
【分类号】:X172
【目录】:
  • 致谢5-6
  • 序言6-7
  • 摘要7-11
  • Abstract11-16
  • 目录16-19
  • 1 引言19-42
  • 1.1 湿地微生物氮素循环及其意义19-21
  • 1.1.1 湿地的生态功能与分类19-20
  • 1.1.2 湿地氮循环的意义与主要生物过程20-21
  • 1.2 ANAMMOX与N-DAMO反应的发现及其生态学意义21-22
  • 1.2.1 ANAMMOX与N-DAMO反应的发现21-22
  • 1.2.2 ANAMMOX与N-DAMO反应的生态学意义22
  • 1.3 ANAMMOX与N-DAMO微生物及其生化反应机理22-28
  • 1.3.1 ANAMMOX微生物及其生化反应机理22-26
  • 1.3.2 N-DAMO微生物及其生化反应机理26-28
  • 1.4 ANAMMOX和N-DAMO微生物生态学研究现状28-39
  • 1.4.1 ANAMMOX微生物生态学研究现状28-36
  • 1.4.2 N-DAMO微生物生态学研究现状36-39
  • 1.5 论文研究目标及基本思路39-42
  • 2 淡水湿地ANAMMOX菌群落组成、多样性、数量和活性研究42-80
  • 前言42
  • 2.1 材料与方法42-49
  • 2.1.1 取样区状况及取样点设置42-46
  • 2.1.2 理化因子测定46
  • 2.1.3 DNA抽提与PCR扩增46-47
  • 2.1.4 克隆与测序47
  • 2.1.5 定量PCR47-48
  • 2.1.6 系统发育分析48
  • 2.1.7 生物统计学分析48
  • 2.1.8 稳定同位素活性示踪48-49
  • 2.2 结果49-74
  • 2.2.1 钱塘江沉积物ANAMMOX菌群落组成、多样性和数量49-54
  • 2.2.2 下渚湖湿地ANAMMOX菌群落组成、多样性、数量和活性54-62
  • 2.2.3 水稻田湿地ANAMMOX菌群落组成、多样性、数量和活性62-67
  • 2.2.4 西溪湿地ANAMMOX菌群落组成、多样性、数量和活性67-74
  • 2.3 讨论74-78
  • 2.3.1 淡水湿地系统ANAMMOX菌的群落结构分析74-75
  • 2.3.2 淡水湿地系统ANAMMOX菌的数量分析75-76
  • 2.3.3 淡水湿地系统ANAMMOX菌的活性及其在氮循环中的作用分析76-78
  • 2.4 小结78-80
  • 3 淡水湿地N-DAMO菌群落组成、多样性、数量和活性研究80-112
  • 3.1 材料与方法80-83
  • 3.1.1 取样区状况及取样点设置80
  • 3.1.2 理化因子测定80
  • 3.1.3 DNA抽提与PCR扩增80-82
  • 3.1.4 克隆与测序82
  • 3.1.5 定量PCR82
  • 3.1.6 系统发育分析82
  • 3.1.7 生物统计学分析82
  • 3.1.8 稳定同位素活性示踪82-83
  • 3.2 结果83-106
  • 3.2.1 钱塘江沉积物N-DAMO菌群落组成、多样性和数量83-88
  • 3.2.2 下渚湖湿地N-DAMO菌群落组成、多样性、数量和活性88-95
  • 3.2.3 水稻田湿地N-DAMO菌群落组成、多样性、数量和活性95-100
  • 3.2.4 西溪湿地N-DAMO菌群落组成、多样性、数量和活性100-106
  • 3.3 讨论106-110
  • 3.3.1 淡水湿地N-DAMO菌的群落结构分析106-108
  • 3.3.2 淡水湿地N-DAMO菌的数量分析108
  • 3.3.3 淡水湿地N-DAMO菌的活性及其在甲烷氧化中的作用分析108-110
  • 3.4 小结110-112
  • 4 滨海湿地ANAMMOX菌群落组成、多样性、数量和活性研究112-141
  • 4.1 材料与方法112-117
  • 4.1.1 取样区状况及取样点设置112-116
  • 4.1.2 理化因子测定116
  • 4.1.3 DNA抽提与PCR扩增116
  • 4.1.4 克隆与测序116
  • 4.1.5 定量PCR116
  • 4.1.6 系统发育分析116-117
  • 4.1.7 生物统计学分析117
  • 4.1.8 稳定同位素活性示踪117
  • 4.2 结果117-133
  • 4.2.1 椒江河口ANAMMOX菌群落组成、多样性和数量117-122
  • 4.2.2 舟山海岛潮间带ANAMMOX菌群落组成、多样性、数量和活性122-128
  • 4.2.3 杭州湾海域ANAMMOX菌群落组成、多样性、数量和活性128-133
  • 4.3 讨论133-139
  • 4.3.1 滨海湿地ANAMMOX菌的群落结构分析133-137
  • 4.3.2 滨海湿地ANAMMOX菌的数量分析137
  • 4.3.3 滨海湿地系统ANAMMOX菌的活性分析137-139
  • 4.3.4 滨海湿地系统ANAMMOX菌在氮循环和作为无机氮汇中的作用分析139
  • 4.4 小结139-141
  • 5 滨海湿地N-DAMO菌群落组成、多样性、数量和活性研究141-167
  • 5.1 材料与方法141-143
  • 5.1.1 取样区状况及取样点设置141
  • 5.1.2 理化因子测定141-142
  • 5.1.3 DNA抽提与PCR扩增142
  • 5.1.4 克隆与测序142
  • 5.1.5 定量PCR142
  • 5.1.6 系统发育分析142
  • 5.1.7 生物统计学分析142
  • 5.1.8 稳定同位素活性示踪142-143
  • 5.2 结果143-159
  • 5.2.1 椒江河口N-DAMO菌群落组成、多样性和数量143-148
  • 5.2.2 舟山海岛潮间带N-DAMO菌群落组成、多样性、数量和活性148-154
  • 5.2.3 杭州湾海域N-DAMO菌群落组成、多样性、数量和活性154-159
  • 5.3 讨论159-166
  • 5.3.1 滨海湿地系统N-DAMO菌的群落结构分析159-163
  • 5.3.2 滨海湿地系统N-DAMO菌的数量分析163-164
  • 5.3.3 滨海湿地系统N-DAMO菌的活性及其在甲烷氧化中的作用分析164-166
  • 5.4 小结166-167
  • 6 湿地ANAMMOX反应和N-DAMO反应的生态环境效应评价167-182
  • 6.1 通量计算与分析167-177
  • 6.1.1 淡水湿地ANAMMOX反应所致的氮气产生通量168-169
  • 6.1.2 滨海湿地ANAMMOX反应所致的氮气产生通量169-171
  • 6.1.3 淡水湿地N-DAMO反应所致的氮气产生通量171-172
  • 6.1.4 滨海湿地N-DAMO反应所致的氮气产生通量172-174
  • 6.1.5 淡水湿地N-DAMO反应所致的甲烷氧化量174-175
  • 6.1.6 滨海湿地N-DAMO反应所致的甲烷氧化量175-177
  • 6.2 讨论177-180
  • 6.2.1 ANAMMOX与N-DAMO在氮循环和平衡氮收支中的重要意义177-178
  • 6.2.2 ANAMMOX与N-DAMO在缓解水体富营养化中的重要意义178-179
  • 6.2.3 ANAMMOX与N-DAMO在控制温室气体排放中的重要意义179-180
  • 6.3 结论180-182
  • 7 结论与展望182-187
  • 7.1 主要结论182-185
  • 7.2 创新点185-186
  • 7.3 不足与展望186-187
  • 参考文献187-199
  • 个人简历199-206
  • 研究生阶段所取得的科研成果199-206
  • 论文发表情况199-204
  • 专利获得情况204-206
  • 奖励获得情况206


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