产甲烷菌高度紧密子网络分析

【摘要】：为了从系统水平上阐明嗜热菌的耐热机制,并指导嗜热菌在工业生产上的进一步应用,以产甲烷菌的代谢网络作为研究对象,从研究代谢网络的拓扑结构以及高度紧密子网络出发,探索常温产甲烷菌Methanosarcina acetivorans(M.acetivorans)和嗜热产甲烷菌Methanopyrus kandleri(M.kandleri)之间的代谢网络的耐热性的差异。实验结果发现常温产甲烷菌M.acetivorans最紧密的9-核和嗜热产甲烷菌M.kandleri最紧密的7-核分别包含27和19个酶。其中嗜热产甲烷菌M.kandleri网络中最紧密的7-核被分成2个子网,一个子网中的酶节点刚好是2个产甲烷菌所共同的酶,而另一个子网络中的酶是嗜热产甲烷菌M.kandleri 7-核所特有的酶,这些特有的酶全部与酪氨酸的合成有关。 【作者单位】： 江南大学物联网工程学院;
【关键词】： 代谢网络 产甲烷菌 网络拓扑 耐热性
【分类号】：TQ221.11
【正文快照】： j al^- P 近几年来随着数百种生物的全基因组测序的完成,以及对基因功能不断深入和广泛的了解,各种生物网络的研究在生命科学领域中越来越受到重视。而其中的代谢网络因其信息的完备性和可靠性成为系统生物学领域一个重要的研究对象。 代谢网络是生物体真实代谢系统的抽象,是

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